为达到预期的性能，家禽呼吸系统承受着巨大的生产压力，免疫生理反应和气体交换时刻都面临着挑战。呼吸系统疾病的管理在家禽生产中至关重要。

呼吸系统处理气体交换，具有三个重要功能：加热和加湿吸入的空气；将空气均匀地分配到肺部的最深处，并作为身体防御系统的一部分发挥作用。

肺是一个脆弱的器官，因为它与环境中存在的物质不断交换，每天吸入的空气中含有大量的病原体、过敏原和污染物。

呼吸道上皮细胞的多样性以独特的方式促进肺内稳态。呼吸道有三种防御机制：纤毛、粘液分泌和免疫细胞。

纤毛：气管及支气管主要由假复层上皮覆盖，其表面覆盖着纤毛细胞。纤毛因其有节奏的运动而发挥着多种重要功能，例如，通过排出积聚在粘膜中的颗粒，防治微生物攻击呼吸道。

粘液分泌：杯状细胞负责在呼吸道产生粘蛋白层，粘液由95%的水和2%的富含唾液酸的糖蛋白组成。粘蛋白是先天免疫系统的一部分，消除病原体和细胞碎片；形成凝胶状的聚合蛋白层，通过纤毛运动沿着气道向上移动。

气管中粘液产生的均匀性对于提高纤毛活动至关重要，细菌或病毒感染会产生更密集或更粘稠的粘液层。

除了先天防御系统外，还有上皮细胞识别微生物病原体及其产物，启动信号转导，以招募和沟通免疫系统细胞。

免疫细胞：气道上皮细胞、树突状细胞和（下呼吸道）肺泡巨噬细胞 (AM) 遇到吸入抗原并触发促炎或抗炎免疫反应的初始控制点。 

肺巨噬细胞和树突状细胞 (DC) 位于呼吸系统和毛细血管上皮表面，对空气和血液传播的物质进行采样和检查。在与肺泡上皮细胞的沟通中，建立免疫反应的阈值和质量。DC 专门通过识别和加工抗原并将其呈递给T细胞，启动适应性免疫反应。

肺泡巨噬细胞会适应组织不断变化的需求。在巨噬细胞中，从炎症耐受状态的变化伴随着 IL-1、IL-6 和 TNF（肿瘤坏死因子）的分泌。巨噬细胞的吞噬能力，包括去除死亡细胞，大大增加炎症状况或感染，因为吞噬和炎症是通过与病原体结合起作用的。

从细胞的角度来看，肺先天免疫细胞可以分为两类：第一，粒细胞（嗜异性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞），它们寿命短，在气道局部激活后迅速将其有毒和有害成分（蛋白酶和氧化剂）释放到组织中，具有更高的急性致病潜力。其次，单核细胞（单核细胞、肺泡/间质巨噬细胞和树突状细胞）寿命更长，在酶和介质释放方面受到更大的控制，主要作为抗原呈递细胞和凋亡体/碎片和入侵微生物的收集者。

肺内的嗜血细胞构成了这些细胞在体循环中最重要的储存库。中性粒细胞根据需要执行促炎和抗炎作用，以有效杀死病原体并解决炎症。

病毒或细菌感染会损害纤毛细胞，导致炎症介质的释放，导致毛细血管的通透性增加，从而引起水肿。水肿是导致咳嗽、打喷嚏、发烧和充血的原因。

由于家禽养殖场对生产的需求不断增长，呼吸道疾病对不同病原体的发病率和恶化程度更高，上皮、纤毛和炎症反应的损害使抗生素本身的效率不同，控制呼吸道的炎症反应和粘液分泌是获得更好治疗反应的关键。